應(yīng)對(duì)武漢發(fā)生的新型冠狀病毒疫情,中國(guó)疾病預(yù)防控制中心迅速完成了病毒全基因組測(cè)序、PCR診斷試劑研制、病毒電鏡圖片制作、病毒分離培養(yǎng)等多項(xiàng)工作,專業(yè)性和應(yīng)急反應(yīng)速度得到了相關(guān)政府部門的肯定,世界衛(wèi)生組織WHO也對(duì)我國(guó)公布病毒基因組一事表達(dá)了感謝。
但對(duì)于這個(gè)新型病毒,十幾天來,人們?nèi)耘f不知道它從哪里來,有何致病特征,致病機(jī)制是什么……“如果病原體數(shù)據(jù)庫(kù)中的病毒群和未知病毒存在一定的同源性,就像是它的各種‘親戚’,如果針對(duì)每一位親戚都有一定的了解,有對(duì)應(yīng)的檢測(cè)試劑、抗體以及相關(guān)信息,那么對(duì)未知病毒的應(yīng)對(duì)將快更多。”1月17日-18日,香山科學(xué)會(huì)議召開的“病原組國(guó)家大數(shù)據(jù)與生物安全”學(xué)術(shù)討論會(huì)上,相關(guān)專家表示新型冠狀病毒或新發(fā)病原體引發(fā)的傳染病正在探索“治本”方案。
宿主消失,“第一線索鏈”中斷
當(dāng)新的病原體開始威脅人的健康,人們需要回答“是什么?為什么?從哪來?如何治?”的問題。北京化工大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院教授童貽剛解釋,“新發(fā)傳染病發(fā)生之后,我們至少要回答四大問題:病原體是什么?病原體如何致?病原體從哪里來?該病應(yīng)該如何治療?”
目前看來,經(jīng)過十幾天來緊張的研究,武漢不明原因的病毒性肺炎疫情中第一個(gè)問題有了答案:實(shí)驗(yàn)室檢出一種新型冠狀病毒,獲得該病毒的全基因組序列。
然而線索鏈在第二個(gè)問題卡住了——病原從哪里來至今未解。
華南海鮮市場(chǎng)已經(jīng)休市,該市場(chǎng)雖被稱為為海鮮市場(chǎng)其實(shí)也很可能非法售賣其他野生動(dòng)物,但目前市場(chǎng)監(jiān)控視頻已無法調(diào)出、調(diào)查組也難以通過調(diào)查“復(fù)盤”曾經(jīng)真實(shí)的情況,也就難以鎖定攜帶病毒的動(dòng)物,但調(diào)查組的確在華南市場(chǎng)的環(huán)境樣品中檢測(cè)到了新型冠狀病毒,多位資深的病原微生物專家更傾向于病毒是由在這里非法售賣的野生動(dòng)物傳播,并且認(rèn)為究竟是非法售賣了什么,誰非法售賣,將難有確切結(jié)果。
隨著華南市場(chǎng)的休市,病毒的中間宿主也消失了,“制伏”病毒的線索鏈也隨著中斷。第一時(shí)間了解病毒的中間宿主,對(duì)于控制疫情擴(kuò)散和防止疫情復(fù)燃具有重要意義。
病毒身世大“起底”,還差國(guó)家數(shù)據(jù)庫(kù)
病毒隨著宿主“去而復(fù)返”的可能微乎其微,防疫之戰(zhàn)卻一刻不能等,林林總總的遠(yuǎn)近親總能不同角度提供線索,通過將新發(fā)病毒與已知病毒數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),將有助于揭去未知病毒 “面紗”。
“通過全基因組測(cè)序了解它與哪些已知病毒具有同源性,確定新發(fā)病毒的種類,隨后需要通過一些血清學(xué)實(shí)驗(yàn),比如患者恢復(fù)之后體內(nèi)有該病毒的抗體,證明該病毒發(fā)生過感染,應(yīng)該是病原。同時(shí)分離培養(yǎng)病毒,再對(duì)宿主進(jìn)行攻擊,宿主發(fā)病后再一次在發(fā)病宿主身上檢測(cè)到該病毒,才能明確就是這種病毒引發(fā)了疫情。”童貽剛說。
“病原基因組的應(yīng)用可以解決很多以前比較難以解決的問題,比如說檢測(cè)新發(fā)病原體,進(jìn)行病原體的流行狀態(tài)的監(jiān)測(cè)和爆發(fā)的跟蹤,結(jié)合地理、生態(tài)、社會(huì)等因素,研究病原體的發(fā)生、發(fā)展的機(jī)制以及預(yù)測(cè)的流行趨勢(shì),分析病原體的耐藥特征,為臨床用藥提供參考等。”童貽剛一口氣列舉了病原體國(guó)家數(shù)據(jù)庫(kù)的“能量”。
中國(guó)科學(xué)院微生物研究所研究員朱寶利表示,病原組國(guó)家數(shù)據(jù)庫(kù)建設(shè)應(yīng)包括病原體的分離培養(yǎng)和保存,病原體表型(致病性、耐藥性等)鑒定和基因組完成圖測(cè)定以及病原體基因型與表型的對(duì)應(yīng)分析,形成病原組綜合數(shù)據(jù)庫(kù)。“如果數(shù)據(jù)庫(kù)足夠龐大和深入,最終將可以通過基因組序列確認(rèn)病原體的致病性和耐藥性,以及病原體的來源,對(duì)病原體實(shí)現(xiàn)快速鑒定和溯源。”
提前預(yù)測(cè),可以做到
等到傳染病突然暴發(fā)就晚了,能不能做到預(yù)測(cè)、預(yù)警?
中國(guó)工程院院士徐建國(guó)表示,近年來,我國(guó)科學(xué)家發(fā)現(xiàn)的3種新的病原體,都是先分離到微生物,后發(fā)現(xiàn)人類病例,如溫州病毒、山羊無形體、荊門蜱傳病毒等,在發(fā)現(xiàn)之初都對(duì)其致病性做了預(yù)測(cè)。
“目前已知的人類病毒不到病毒種類的1%,隨著人類活動(dòng)范圍的不斷擴(kuò)大、社會(huì)與地理生態(tài)環(huán)境的不斷變化,人類與野生動(dòng)物、昆蟲等媒介動(dòng)物的接觸機(jī)會(huì)不斷增多。這些在自然界長(zhǎng)期存在的病原體突破物種屏障傳播到人和家畜造成新發(fā)傳染病的概率將大大增加。”徐建國(guó)說,反向病原學(xué)(先發(fā)現(xiàn)、分離、評(píng)估新的微生物,后預(yù)測(cè)可能引發(fā)傳染病的病原體)越來越被證實(shí)可行。
當(dāng)務(wù)之急是重視野生動(dòng)物微生物組的調(diào)查研究,提出可能出現(xiàn)的新發(fā)突發(fā)病原體目錄,即“劃重點(diǎn)”。“冠狀病毒應(yīng)該列為重點(diǎn)排查對(duì)象,近些年反復(fù)出現(xiàn),近些年我們一直在發(fā)現(xiàn)一些致死性的新發(fā)冠狀病毒。”童貽剛說。
此外,相關(guān)專家認(rèn)為,蜱蟲作為中間宿主不僅會(huì)促成病原體跨種間的傳播,還會(huì)使病毒變異速度陡升,也是未知病毒的典型“集散地”。
不管哪種“補(bǔ)鏈”手段,都是基于常年、深入的基礎(chǔ)研究和層次分明的數(shù)據(jù)積累,更離不開高效科學(xué)合理的頂層設(shè)計(jì),以及具體操作上的對(duì)數(shù)據(jù)的組織和管理。